有孔胃隔膜应与先天性肥厚性幽门狭窄相鉴别，前者除腹部摸不到肿块外，X线表现有以下特点：①幽门部没有向腔内突出的“肩征”，而且呈弧形状。②胃小弯下部没有乳头征象。③幽门部没有不变的“鸟嘴”征象。④因隔膜以上胃腔无狭窄，因而无幽门管拉长征象。⑤因幽门没有肿块，十二指肠球部没有伞状表现或弧形压迹。