1.甲状舌管囊肿和瘘的切除须完全，尤以有多数囊肿或瘘道分支时更应注意。瘘道上皮残留即可造成复发。切除舌骨中段及舌骨以上病变组织至为重要，在未能找到通向盲孔的明显管索时，亦应将舌骨与盲孔间正中线部位肌肉做柱状切除。囊肿下方有时呈漏斗状与甲状腺锥状叶相连，亦应切除。

2.颈正中部有时可见球状之异位甲状腺组织，需要时取小块送快速病理切片确认。在探查确证正常的甲状腺叶存在后，才可切除异位腺体。

3.术中注意防止过度分离乃至损伤颌下腺，后者可形成瘘管。