主要是精神障碍的鉴别诊断。器质性与非器质性精神障碍的鉴别十分重要，否则会延误诊断和治疗。有时在一些器质性病因不明显的病例鉴别甚为困难，如上所述躯体疾病有时会出现一些功能性精神疾病症状，如焦虑、抑郁、类精神分裂症、躁狂等，此时要区别是躯体疾病伴发的器质性精神障碍，还是为其所诱发的精神疾病;当躯体疾病伴有失眠、焦虑、抑郁等症状时，是由生物学因素的影响，还是躯体疾病带来的心理应激所致;既精神分裂样表现需要与精神分裂症相鉴别。临床往往很难区分，而且两者也常常是共存的。症状性精神障碍实质是指前者。两者的鉴别主要依靠医生掌握全面的病史(包括躯体和精神疾病史)，根据慢性肺部疾病史、肺功能不全及阵发性精神紊乱，病程中可能出现的意识障碍，仔细的体格检查及相应的生化及内分泌等实验室阳性发现，进行综合判定以资鉴别。