临床上应注意与肥胖绦虫病和链状带绦虫病相鉴别。复孔绦虫病与肥胖绦虫病和链状带绦虫病同属绦虫感染，临床症状也很相似，所以可以通过三种绦虫形态学上的差异来鉴别。肥胖带绦虫无顶突及小钩;链状带绦虫有顶突和2环小钩;复孔绦虫有顶突，顶突上有约4环60个小钩。