根据病因及病理表现的不同，可分为外森性黏液囊肿及潴留性黏液囊肿。

1、外渗性黏液囊肿 占黏液囊肿的80%以上，组织表现为黏液性肉芽肿或充满黏液的假囊，无上皮衬里。实验研究提示，外渗性黏液囊肿是由创伤引起的。

2、潴留性黏液囊肿 有上皮衬里、潴留的黏液团快及结缔组织被膜，发病原因主要是导管系统的阻塞，可由微小涎石、分泌物浓缩或导管系统弯曲等原因所致。