对比较复杂的阻生智齿如下颌近中、水平低位阻生的智齿拔除时，会造成周围组织较大创伤，引起的并发症也比较剧烈，局部用药还不足以预防和治疗这些并发症，因此应针对智齿拔除时的具体情况选择全身用药。
拔牙时，骨组织和软组织皆受到不同程度的损伤，创伤导致的代谢分解产物和组织反应应激物刺激神经末梢，引起疼痛。另外，拔牙窝内凝血块脱落，使牙槽神经末梢暴露也会引起疼痛。需与干槽症引起的疼痛相鉴别。创伤较大的拔牙术，特别是下颌阻生智齿拔除术后，常会出现疼痛，因此术后应常规使用镇痛剂，一般应用1~2天即可。
镇痛剂可分为以下几种： 非甾体类解热镇痛抗炎药（NSAID） 本类药物仅对中度疼痛有效，是预防和治疗智齿拔除引起疼痛的主要药物。本类镇痛作用不是作用于阿片受体，而是对前列腺素合成酶有强大的抑制作用，其镇痛效应在组织有炎症时更为显著。
本类药物按化学结构可分为许多类。如： 甲酸类：也称水杨酸类，代表药物为阿司匹林、双氟尼柳； 乙酸类：代表药物为双氯芬酸、吲哚美辛、舒林酸和依托芬那酯等； 丙酸类：代表药物为布洛芬、酮基布洛芬、芬布芬、萘普生、奥沙普秦、丙嗪等； 昔康类（吡罗昔康、美洛昔康、替诺昔康、罗诺昔康）； 昔布类（塞来昔布、罗非昔布）； 吡唑酮类包括安乃近、氨基比林、保泰松、羟基布他酮； 其他（尼美舒利）。
多数NSAID可抑制血小板聚集，使出血时间延长，因此在智齿拔除后应选择性使用对血小板影响小的药物。
中枢类镇痛药 选择性地作用于中枢神经系统的某些部位，以减轻或解除疼痛的药物。常用的镇痛药有以下三类：①阿片类：吗啡、阿片全碱等；②苯基哌啶类：哌替啶（度冷丁）、安依度（安那度）等；③其他合成镇痛药：美散痛（非那酮）、镇痛新、强痛定等。在镇痛作用时可选择性地减轻或缓解疼痛感觉，但不影响意识、触觉、听觉等，同时因疼痛引起的精神紧张、烦躁不安等不愉快情绪也可得到缓解，这就有助于耐受疼痛。本类药物的镇痛作用强大，多用于剧烈疼痛。在预防和治疗智齿拔除引起的疼痛中很少应用。