磨牙咬合关系是磨牙能否正常行使功能的重要保证，正位萌出的智齿不仅能形成正常的咬合关系，同时又不影响第一、第二磨牙行使功能，还能对食物进行研磨，使食物便于吞咽。而非正位的智齿，可能会妨碍到正常咬合关系的建立，还有可能引起错畸形。
干扰性咬合
智齿萌出后，可与对颌的同名牙或（和）其邻牙（第二磨牙）发生“牙合”面接触关系，或在牙尖交错时与对颌第二磨牙远中邻面密切接触，即有干扰性咬合接触关系。也可以暂时因萌出受阻（阻生牙）或萌出尚未到位等原因，与对颌牙没有接触。但有些智齿虽然阻生，其萌出的部分仍然可以与对颌牙发生咬合接触关系，如近中高位阻生的智齿若远中尖或远中边缘嵴过于高耸，可能与上颌第二磨牙形成咬合，抬高咬合致使上下颌的第二磨牙不能形成正常的咬合关系，使得咀嚼效率下降，并导致食物嵌塞。
阻生智齿干扰性咬合
上下颌智齿存在相互制约的关系，若单颌智齿萌出位置不正，形成过于高耸的牙尖或边缘嵴并能与对颌智齿形成咬合关系时，对颌智齿由于不良咬合接触的存在不能继续生长，故造成在无骨阻力的情况下智齿不能正位完全萌出。
深覆盖、正锁牙合
智齿深覆盖是指上颌智齿的舌尖顶位于下颌智齿中央窝的颊侧，几乎与其颊尖顶相对。若上颌智齿的位置更加偏向颊侧时，则上颌智齿的舌尖顶完全位于下颌智齿的颊侧，即形成了智齿的正锁。
智齿发生深覆盖或正锁时，不仅智齿不能正常的行使咀嚼功能，而且由于上下智齿牙尖的干扰致使单侧后牙不能进行侧方运动，降低咀嚼效率，导致牙体及牙周组织的损伤。
阻生智齿正锁“牙合”
反牙合、反锁牙合 智齿反即上颌智齿腭侧阻生，而下颌智齿颊侧阻生，这样上颌智齿的腭尖位于下颌智齿的中央窝内。下颌智齿在更加偏向颊侧时，上颌智齿的颊尖可能完全位于下颌智齿的舌侧，此时即为智齿的反锁。
同上所述，智齿的反或反锁也会干扰到口腔的侧方运动，降低咀嚼效率，使食物在口腔内不能充分的捣碎和磨细。
近远中向咬合接触不良
智齿近远中向咬合接触不良是指因上、下颌智齿长轴的近远中向倾斜程度不协调，或有不同程度的扭转，导致上、下颌智齿不能完全呈尖-窝对应接触关系，而呈凸面与凸面接触关系的现象。
