本病最常并发肺炎，，严重威胁患儿生命。另外可以并发脑栓塞。

　　1、肺炎

　　为本病最常见的并发症，且病情严重，病死率高。

　　症状：出现发热、心悸、气促、肺浸润、炎症体征和某些X线表现。

　　肺炎治愈后一般不留瘢痕，肺可以恢复其原来的结构和功能。

　　2、脑栓塞

　　机制：心内膜的损伤，心脏扩大，血液缓慢淤滞，易形成附壁血栓。心房颤动时不规则的血流使附壁血栓脱落，阻塞脑血管，引起局部脑组织缺血缺氧，导致脑栓塞。

　　症状：出现偏瘫、偏身麻木、讲话不清等突然发生的局源性神经功能缺损症状。

　　3、心源性休克

　　见于少数患儿

　　症状：面色灰白、烦躁、四肢湿冷及脉搏加速而微弱等。