经尿道前列腺切除术的术后合并症可分成早期并发症和晚期并发症两大类。

早期并发症有经尿道电切综合征，又称低钠血症，尿路感染，休克，弥漫性血管内凝血等，因发生很少，又都会在住院期间得到治疗、就不详细叙述了。只是经尿道前列腺电切综合征为这种手术所特有，故稍加说明。经尿道前列腺电切术不是在直视下进行，为保持手术视野清晰和冲出切割下的组织，必须在电切割中不断进行冲洗，冲洗液就会源源不断地吸收入血。如果过多的水吸收入组织细胞，则会引起低钠血症和水中毒，即机体可能发生脑水肿、肺水肿和心力衰竭。因此，该手术必须严格控制手术时间和冲洗液量，防止综合征的发生。

术后晚期并发症是患者出院以后发生的，因此需要患者自己留心观察和发现。

(1)术后仍然排尿不畅甚至出现尿潴留其原因有：一为手术中增生腺体切除不全，解决办法再次电切；二为患者原来就同时存在神经性缺陷使排尿困难，应该给予相应检查和治疗，并向患者解释清楚双重原因。

(2)排尿异常术后有时见显微镜下血尿，脓尿持续数月。究其原因也有两个：一为创面愈合过程虽坏死组织逐渐脱落引起，二为可能有肾脏病变。因此，应该做有关的详细检查以弄清原因并给予处理。

(3)附睾炎因手术前后预防性抗生素的应用，附睾炎的术后发病率已大大降低，但仍有少数发生，若术后发生阴囊内肿痛应及时就诊。

(4)尿失禁可能与手术有关，也可能为炎症、肿瘤、结石或者神经性因素引起，因此，应该做相应检查找出原因。

(5)尿道狭窄应仔细找出狭窄部位，给予尿道扩张，或者再次电切处理。

(6)性功能障碍术后约1.4%的患者发生阳痿。还有不少患者诉性交不满意，其原因可能与精神因素有关，应该给予心理疏导。由于电切术后可能引起尿道内括约肌关闭不全，导致逆行射精，即精液不排出体外而进入膀胱。无生育问题者不必治疗，有生育要求者，可试用麻黄素治疗，有时有效。