毛圆线虫常与钩虫混合感染，因两者临床表现相似，故本病与钩虫病临床鉴别有时较难。两者主要根据虫卵的下列特点进行鉴别：东方毛圆线虫的虫卵较钩虫卵大。毛圆线虫的虫卵为长椭圆形，两端大小不同，长径超过横径2倍以上;钩虫卵为椭圆形，两端大小几乎相等，长径不及横径2倍。毛圆线虫卵壳较钩虫卵壳稍厚，两端有类新月状空隙，内含10～20个卵细胞;钩虫卵的卵膜与卵壳不密集，无新月形空隙，其内含卵细胞仅2～8个。根据以上两种虫种的形态学特征可以通过实验室检查涂片法、漂浮富集法检测鉴别。