1．沙眼衣原体分为三个生物变种，即沙眼生物变种（biovartrachoma）、性病淋巴肉芽肿生物变种（biovarlymphogranulomavenereum,LGV）和鼠生物变种（biovarmouse)。 2．沙眼生物变种专门寄生于人类，易感部位是黏膜的鳞状上皮细胞。人与人之间的传播方式有两种明显不同类型：在沙眼流行地区，主要通过眼-眼及眼-手-眼传播，引起地方性致盲沙眼；另一种系性接触传播，是STD中最常见的病原体，可引起泌尿生殖系感染、新生儿经产道时感染以及其他合并症，主要有新生儿包涵体结膜炎、新生儿肺炎、NGU、附睾炎、前列腺炎、宫颈炎、输卵管炎、直肠炎等，且在女性可易致不育和异位妊娠等严重后果。 3．对急性期沙眼或包涵体结膜炎患者，以临床诊断为主，实验室检查可取眼穹窿部及眼结膜分泌物做涂片，染色检查上皮细胞内有无包涵体。 4．对泌尿生殖道感染，临床症状不典型，主要依靠实验室检查，可采集泌尿生殖道标本做Giemsa或碘液染色检查包涵体，但敏感性差，阳性率仅约40％。细胞培养法是目前生殖道衣原体检测的最好方法。而且是评价其他实验室诊断方法的“金标准”，目前已有商品化的试剂盒。衣原体分离培养阳性伴有尿道炎症状者，是非淋菌性尿道炎的指征。从尿道炎患者中分离获得衣原体，并不能断定它是惟一的病原体。因为在30%～50％的非淋菌性尿道炎患者、20%的淋病患者和5％性活跃但无尿道症状的人群中，用细胞培养法均可找到沙眼衣原体。 采用直接荧光抗体检测标本内的衣原体，一般要求衣原体数>10个方可判为阳性。有条件的实验室可采用DNA探针和PCR技术、PCR-EIA技术、连接酶链反应（LCR）检测衣原体特异性基因片段。目前还有一些商品化的快速诊断衣原体抗原的方法，如乳胶免疫扩散法、利用单克隆抗体检测衣原体LPS法等。 5.人是性病淋巴肉芽肿亚种（LGV）的天然宿主，经性接触传播，主要侵犯淋巴组织，引起多种临床症状，典型症状是男性腹股沟淋巴肉芽肿。在女性侵犯会阴、肛门和直肠，可形成肠皮肤瘘管；也可引起会阴-肛门-直肠狭窄和梗阻。可采用微量免疫荧光法检测，与其他型沙眼衣原体交叉反应较低，有较高的诊断价值。