性交困难的原因有男方与女方两个方面。

男方常见的原因有：1.性功能障碍。如患阳痿，阴茎不能勃起或阴茎勃起不坚，阴茎不能插入阴道;又如早泄，由于射精过快，可于阴道外射精，射精后阴茎即疲软，招致阴茎不能插入阴道。2.生殖器畸形。如两性畸形，阴茎过于短小，阴茎无法与妇方交接。3.不懂性知识。男方对女性生殖器构造及性交基本知识一无所知，性交时动作笨拙，方向不明，不知所措，停留在外阴部盲目撞击，性器未曾交合。

妇方常见的原因有：1.性功能障碍。如女方在性交时由于恐惧，焦虑，紧张等心理原因造成阴道痉挛，两腿并拢，阴道口紧缩，造成男方无法将阴茎插入阴道。2.生殖器畸形。例如女方患处女膜闭锁，先天性无阴道或两性畸形患者，由于无阴道，也无法与丈夫交接。3.生殖器损伤疾病。如女性分娩时造成产道损伤及感染，产后阴道炎症形成瘢痕继而使阴道粘连狭窄，性交时造成性交障碍。又如分娩时会裂伤，若缝合过高过紧，个别情况下也可造成性交困难。4.外阴疾患。例如外阴巨大橡皮肿，阴道口被橡皮肿遮盖，阻挡前进去路，使阴茎无法插入阴道。前庭大腺囊肿，如体积较大，也可造成性交困难。