有切口感染，颅内出血，急性脑干移位，梗阻性脑积水。晚期并发症主要是脑表面含铁血黄素沉积症（cerebral hemosiderosis），后者多在术后4~20年后出现。表现为精神萎靡、嗜睡、震颤、共济失调、慢性颅内压增高。X线和CT扫描发现残留脑室扩大，切除半球的腔内液体蛋白含量高，并有含铁血黄素。常因轻微头部外伤，神经系统症状恶化而突然死亡。如能及时行脑脊液分流术，可减轻症状。目前经典的大脑半球切除已被改良的和功能性大脑半球切除所取代。